Отдел организации учебного процесса является структурным подразделением Учебного управления, обеспечивающим формирование статистических и отчетных форм Университета, выполняющим функции информационного обеспечения, подготовки и проведения процедур лицензирования и аккредитации образовательных программ, взаимодействие с Департаментом координации деятельности организаций высшего образования Минобрнауки.

Основными задачами отдела организации учебного процесса являются:

• Подготовка комплектов документов для участия в ежегодном открытом публичном конкурсе по распределению контрольных цифр приема по специальностям и направлениям подготовки для обучения по образовательным программам высшего образования и среднего профессионального за счет бюджетных ассигнований федерального бюджета
• Предоставление статистических данных по формам статистической отчетности: ВПО-1, СПО-1, 1-Мониторинг «Мониторинг по основным направлениям деятельности образовательной организации высшего образования», «Мониторинг инклюзивного высшего образования».
• Подготовка отчетов по выполнению государственного задания;
• Организация государственной итоговой аттестации выпускников: согласование председателей ГЭК в Минобрнауки, выпуск приказов по составу государственных экзаменационных комиссий;
• Подготовка комплекта документов для прохождения процедуры лицензирования новых образовательных программ;
• Подготовка комплектов документов для прохождения процедур государственной аккредитации и профессионально-общественной аккредитации;
• Подготовка ежегодного отчета о самообследовании;
• Выпуск ежегодного сборника «Организация учебно-методической и научной работы ГУАП»;
• Подготовка материалов по образовательным программам, вошедшим в ежегодный сборник «Лучшие образовательные программы инновационной России»;
• Организация участия в экспериментах по независимой оценке качества образования, организованных Рособрнадзором и другими организациями;
• Заполнение ежегодной анкеты КНВШ Санкт-Петербурга;
• Мониторинг контингента обучающихся в течение учебного года и предоставление данных по контингенту другим подразделениям для заполнения отчетов и анкет РАЕХ, Интерфакс и других рейтингов
• Сбор заявок от подразделений на печатную продукцию для изготовление в РИЦ