- руководит организацией председатель и профсоюзный комитет, избранные на отчетно-выборной профсоюзной конференции ГУАП
- председатель профкома избран членом Ученого совета университета и является членом ректората
- контроль за финансовой деятельностью профсоюзной организации осуществляет ревизионная комиссия
- текущую работу профкома обеспечивают штатные сотрудники: главный бухгалтер, председатель и два его заместителя
- ежегодно на конференциях всех категорий работников и обучающихся в ГУАП, а также на заседаниях Ученого совета проводится отчет председателя профсоюзной организации о ходе выполнения Коллективного договора между работниками и работодателем
- члены профкома курируют производственную деятельность (трудовые отношения, правовые вопросы, проблемы охраны труда техники безопасности), социальное направление (медицинское обслуживание, социальное страхование, отдых и общественное питание, забота о детях и ветеранах, культурно-массовая работа, спортивно-оздоровительная деятельность, молодежная политика), организационное направление (учет членов профсоюза, внешние связи, информационное обеспечение, анализ общественного мнения)
- членами профкома по должности также являются председатели профбюро факультетов и других крупных структурных подразделений ГУАП
- деятельность профсоюзного комитета контролируется ревизионной комиссией